Siglo XIX
- Guerra de la Independecia
Una vez comenzada la Guerra de Independencia Española (1808-1814), y la entronización de José I Bonaparte, el gobierno decide ordenar el territorio de España dividiéndolo en 38 prefecturas a imagen de las establecidas en Francia, y en 111 subprefecturas, según el proyecto del clérigo Llorente, con el nombre de las mismas relativas a accidentes geográficos (fundamentalmente ríos y cabos), aunque no llegó a entrar en vigor. El actual municipio de Molinicos se encontraría dividido en dos, mientras que la parte noroeste del municipio pertenecería de la prefectura de Ojos del Guadiana (actual Ciudad Real), y de la subprefectura de Alcaraz, el resto lo haría en la prefectura de Segura (actual Jaén).
Durante la Guerra de la Independencia, varios vecinos de la zona de Cañada del Provencio y Vegallera, comandados por el sacerdote de la Cañada del Provencio, marchan a Alcaraz a defender la ciudad de las tropas Napoleónicas, sobre todo entre 1810 y 1811, siendo perseguidos por éstos, así como por desertores del ejército español.
Una vez expulsado el ejército francés de la zona el 13 de febrero de 1812, se celebrará en Vegallera, la primera misa en la recién creada iglesia de la localidad, dedicada a la Inmaculada Concepción, habiendo solicitado la misma al Arzobispo de Toledo.
- Emancipación
El término municipal de Molinicos no fue tan extenso como antaño, sino que pasó por diferentes municipios hasta que en 1846 consiguiera definitivamente su emancipación.
El 21 junio de 1846, y mediante Real Orden del Ministerio de Gobernación, de 26 de mayo de ese mismo año, se manda incluir a las localidades de Fuente - Higuera, Los Alejos y Fuente Carrasca en el distrito municipal de Molinicos.
El 19 de julio de 1858, el Pleno de la Diputación de Albacete estudia una petición de los vecinos de la zona norte de Los Alejos para pasar de Bogarra a Molinicos, fundando su petición por la menor distancia que les separa de Molinicos que de Bogarra. Poco después, y en esa misma sesión, la Diputación estudia también la segregación de La Alfera, Las Ánimas y El Quejigal de Alcaraz, para pasar a Molinicos, empleándose como argumentación ...en que de aquel punto distan seis leguas de penoso camino, cuando de este solo le separa una.[38] Alcaraz se oponía a esta segregación aduciendo la escasez de término que sufría. Pero la Diputación, tras indicar que en el expediente se sigue la Ley de 8 de enero de 1845, determina que ...sin género de duda a los recurrentes asiste entera justicia..., y, por consiguiente, se debe proceder a su agregación a Molinicos, incluyendo ...la porción de terrenos comunes, baldíos o de Propios que se les señale en porción exacta con el número de habitantes....
Finalmente, el 14 de octubre de 1860, el Ayuntamiento de Molinicos en Pleno aprueba la agregación de la zona norte de Los Alejos al municipio, y el 28 de octubre de ese mismo año, tras varios conflictos que surgieron con Alcaraz, el Ayuntamiento de Molinicos procede a la aprobación de la agregación de La Alfera, Las Ánimas y El Quejigal, como localidades de pleno derecho del municipio de Molinicos.
El 12 de noviembre de 1860, se produce la agregación de Mesones o Riomundo,como entonces se conocía a Molinicos tras una nota del Pleno de la Diputación de Albacete, en la que se indica que se han recibido sendas comunicaciones de los Alcaldes de Alcaraz y Molinicos, en las que se hace saber que la aldea de Riomundo, que era de Alcaraz, pasa a pertenecer a Molinicos.
El 15 de mayo de 1861, el Pleno del Ayuntamiento de Molinicos, tras la solicitud de los habitantes de La Vegallera, y de la Cañada del Provencio de segregarse de Alcaraz para pasar a Molinicos, toma un acuerdo por el cual cuando se produjera la incorporación se comprometía a recibirlos como vecinos de pleno derecho. No sería de extrañar, por la antigüedad de la existencia de Alcaraz, que la ciudad conservara ciertos privilegios sobre sus aldeas, y que los vecinos quisieran asegurarse los plenos derechos cuando se incorporaran a Molinicos.
El 3 de marzo de 1863 la Diputación Provincial, mediante Pleno considera que Alcaraz no puede atender debidamente a los vecinos de Cañada del Provencio y Vegallera por su lejanía y, por tanto, se beneficiarían de su incorporación a Molinicos. Aprueba por tanto la incorporación de estas localidades al municipio de Molinicos.
El 23 de abril de 1863 la reina Isabel II firma la Real Orden por la cual se segregan Cañada del Provencio y Vegallera de Alcaraz agregándose a Molinicos, y finalmente el 22 de noviembre de 1863, el Pleno del Ayuntamiento de Molinicos procede a la aprobación de la agregación de Cañada del Provencio y Vegallera al término municipal de Molinicos, poniendo así fin al proceso de ampliación del municipio iniciado en 1846, y configurando el actual territorio.
Siglo XX
Desde mediados del siglo XIX, y hasta mediados del siglo XX, el incremento de la población es exponencial, pasando de los 1.232 habitantes en el año 1857, a los 4.989 que vivían en Molinicos en 1950. A partir de aquí, la falta de empleo y las difíciles condiciones de vida hicieron que muchas personas emigraran en busca de unas condiciones de vida mejor.
En 1929 se solicita la creación de diez escuelas en todo el municipio, concretamente en las localidades de Mesones, La Alfera, Los Alejos, Pinilla, Cañada de Morote, El Pardal, Torre - Pedro, El Morcillar, Cañada del Provencio y La Vegallera, puesto que el aumento de la población hacía necesaria la instrucción de los niños, y el volumen de los mismos era elevado.
Durante los años de la postguerra española, se plantea un contencioso de segregación por parte del vecino municipio de Riópar para anexionarse tanto la localidad de La Vegallera como la Cañada del Provencio. Durante ese mismo, en todo el municipio se recogieron firmas en contra del mismo, y en 1950 se planteó un contencioso que, finalmente, fallaría el Tribunal Supremo a favor de su permanencia en el municipio de Molinicos, lo cual fue celebrado con una gran fiesta y cohetes.
Precisamente en 1950 se inicia la carretera que conecta la carretera autonómica CM-412 con la localidad de La Vegallera, pasando por otras localidades como Pinilla, Los Alejos, La Alfera, Las Ánimas y Cañada del Provencio, que tras varios problemas y retrasos sería terminada en 1970, lo que permitía el acceso a la misma con automóvil. No obstante, no sería hasta 1990 cuando se asfaltaría la calzada sobre el mismo trazado que tenía la pista forestal anterior.
A pesar de la creación en 1950 de la Diócesis de Albacete, no es hasta 1969 cuando la Parroquía de Molinicos, junto con la de La Vegallera y Cañada del Provencio, así otras de la zona (no así la de Yeste que pertenecía a la Diócesis de Cartagena), pasaran a formar parte de ésta procedente de la Diócesis de Toledo, la cual aún poseía importantes territorios en la Sierra de Alcaraz y norte de la provincia de Jaén. Se aunaba así las circunscripciones eclesiásticas y civil.
Un punto importante dentro de la historia de Molinicos en los últimos años fue el incendio que se produjo en 1994, en el vecino municipio de Yeste, y que también afectó al de Molinicos. En total se calcinaron 14.284 hectáreas, y cerca de 1.300 personas de ambos municipios tuvieron que ser evacuadas.